В Яр-Сале из Салехарда можно попасть по воде. Десятого июня по маршруту Салехард - Аксарка - Салемал - Панаевск - Яр-Сале и обратно отправился в рейс теплоход А-145.
Как сообщает правительство ЯНАО, сохраняется субсидирование социально значимых перевозок по межрегиональным и межмуниципальным маршрутам: Салехард - Аксарка - Салемал -Панаевск -Яр-Сале - Ныда и обратно; Салехард - Шурышкары - Мужи и обратно; Салехард - Новый Порт -Антипаюта и обратно, Салехард - Катравож и обратно; Салехард -Питляр - Горки - Лопхари - Казым‑Мыс и обратно; Березово -Салехард - Мужи и обратно; Омск -Тобольск -Ханты-Мансийск - Салехард и обратно.
На маршруте из Березово в Салехард и Мужи пассажиров перевозят теплоходы типа «Метеор». По маршруту «Салехард - Катравож» курсирует теплоход «Фарман Салманов». На маршрутах «Салехард - Шурышкары - Мужи» и обратно, «Салехард - Питляр - Горки - Лопхари - Казым-Мыс», «Салехард - Аксарка - Салемал - Панаевск - Яр-Сале - Ныда» и обратно - теплоходы проекта А-145 «Рем Вяхирев» и «Виктор Черномырдин».
С 28 мая на маршуте «Омск - Тобольск - Ханты‑Мансийск - Салехард» курсируют теплоходы «Механик Калашников» и «Родина». Последний рейс из Салехарда намечен на шестое октября.
Движение по наплавному мосту через реку Пур открыто 
На Ямале объявлено начало пассажирской навигации 
Между Салехардом и Лабытнанги на линии работают шесть паромов 
Перевозку пассажиров между Салехардом и Лабытнанги осуществляет паром 
Ледовая переправа Салехард - Лабытнанги с пятого мая закрыта